Lecompton, fundado en 1854 sobre una concesión de tierras de indios Wyandotte de 640 acres, fue nombrado originalmente Bald Eagle (Águila Calva) debido a las muchas águilas que anidaban a lo largo del río Kansas. Ese mismo año fue renombrado Lecompton en honor al juez Samuel D. Lecompte de Maryland, magistrado en jefe del tribunal supremo territorial de Kansas y presidente de la Lecompton Town Company. La legislatura territorial eligió Lecompton como capital del Territorio de Kansas en agosto de 1855.